Green Hillsen bizitzen jarri ondoren, Sonic hil egingo da benetako heroiaren grina duela erakusteko. Suzko proba Robotnik gaiztoaren itzulerarekin dator, oraingo honetan beste kide batekin, Knucklesekin, zibilizazioak suntsitzeko ahalmena duen esmeralda baten bila. Sonicek taldea osatzen du bere kidearekin, Tailsekin, eta elkarrekin abentura bati ekiten diote, munduan zehar eramango dituena harri preziatuaren bila, okerreko eskuetan eror ez dadin.